Налоги

Здравствуйте. Помогите пожалуйста чайнику, работаю только 2 месяца,проконсультироваться не с кем. Выставили счёт и счёт фактуру на аванс с 5 % ставкой НДС(допустим 500 тысяч), всего будет 5 платежей. В след.счет фактуре сумма полная например 2100млн.а счёт меньше чем в сч.фактуре на 100 тысяч,за минусом аванса 2000млн. Верно ли что счёт фактуры и счёт на разные суммы?